不能。小产权房不能公证，公证的依据是要合法，即使公证无效；所谓小产权，国家不承认，不能上市交易。当然，公证处是不能做这种公证的，即使是国家承认的。“小产权房”不是一个法律概念，而是人们在社会实践中形成的约定俗成的称谓。这种房子没有国家颁发的土地使用证和预售许可证，购房合同也不会在国土房管局备案。所谓的产权证并不是真正合法有效的。
房屋产权有什么区别？发产权证的国家叫“大产权房”，不发产权证的国家叫“小产权房”。大小产权房的纠纷不是房屋的所有权，而是土地的使用权。小产权主要有三种解释：
1.对于开发商的产权，开发商的产权叫大产权，购房人的产权叫小产权，之所以这么叫是因为购房人的产权被开发商的一个产权分割了。
2.根据房屋再过户时是否需要缴纳土地出让金来区分。不需要交土地出让金的叫大产权，要交土地出让金的叫小产权。按照这种解读，普通商品房就是大产权房，经济适用房就是小产权房。
3.以产权证发证机关区分。国家发产权证的，叫大产权。如果国家不发产权证，就叫小产权，也叫乡镇产权。乡镇产权不构成真正的合法产权。
小产权的前两种解释是合法的，只要在转让时支付全部购房款或缴纳土地出让金，就可以自由买卖，其法律规定也比较明确。小产权的法律性质第三种解释有争议，无法取得真正法律意义上的产权证。
