奥迪A6L后备箱宽1040mm，高500mm，深1130mm，容积460L。虽然这样的数据在同级别车型中并不突出，后排座椅也不能放倒，但是A6L的后备箱格局还是很规整的。很明显，名字中的L是轴距上的L，所以后备箱尺寸没有变化。但对于奥迪来说，这还不够提。
A6L可以通过按下遥控钥匙上的后备箱开启按钮或拉动驾驶座车门内的解锁按钮来打开后备箱，后备箱会被解锁并随机弹起。当然也可以通过行李箱盖手柄上的开关打开。当车辆锁定时，按下遥控钥匙上的行李箱打开按钮可以单独解锁行李箱，行李箱盖将再次关闭，然后自动锁定。
看过很多电影，知道很多黑社会团伙开着奥迪去绑架人。如果你不幸被绑住了，也不用担心。贴心的奥迪早就料到会出现这种情况，所以在行李箱盖处设置了紧急解锁。撬开行李箱盖锁着的盖子，找东西，在圆形凹陷处找到。将解锁杆压向一侧，行李箱盖将被解锁。
